Продлённая интубация трахеи чревата такими последствиями как травма дыхательных путей, инфекции, дискомфорт больного, вынуждающий вводить высокие дозы седативных препаратов. Поэтому согласно текущим клиническим рекомендациям, в случаях когда ИВЛ длится более трёх недель, больному накладывают трахеотомию. Однако многие известные специалисты предпочитают раннюю трахеотомию, которая, как они предполагают, защищает больных от вентилятор-ассоциированной пневмонии (ВАП) и улучшает исходы.