Профилактика лямблиоза направлена на предотвращение передачи возбудителя болезни от зараженного им носителя. Для этого проводятся исследования среди детей, посещающих дошкольные и школьные учреждения, персонала этих учреждений, пациентов с иммунодефицитом и заболеваниями ЖКТ различного генеза. Выявленные носители и больные лямблиозом подвергаются лечению или санации.